外贸企业关税、增值税、报验费及外加代理手续费等全额向委托企业收取因海关增值税完税凭证开具给受托外贸企业因此委托企业无法进行进项税抵扣委托企业认部分增值税款应由企业负担又因委托企业直接与国外供货方结算货款受托外贸企业既付资金又无货物也无法抵扣外贸企业认货物企业委托外贸企业代理购进税款应当由委托企业负担国家税务总局国税函发[95]288号文件规定:代理货物行属于增值税条例所称代购货物行应按增值税代购货物征税规定执行鉴于代理进口货物海关完税凭证有开具给委托方有开具给受委托方特殊性对代理进口货物海关开具完税凭证上纳税人增值税纳税人即对报关进口货物凡海关完税凭证开具给委托方对代理方征增值税;凡海关完税凭证开具给代理方对代理方应按规定征收增值税面所述税款应由外贸企业负担好受托外贸企业海关办理报关手续时应及时出示委托代理进口货物协议(合同)完税凭证直接开具给委托企业
如果增值税专用缴款书是开具给代理方的,代理方按照规定征收增值税,同时凭海关开具给代理方的海关增值税专用缴款书抵扣增值税,委托方不允许使用该缴款书抵扣税款。 对对海关代征进口环节增值税开据的增值税专用缴款书上标明有两个单位名称,即,既有代理进口单位名称,又有委托进口单位名称的,只准予其中取得专用缴款书原件的一个单位抵扣税款。申报抵扣税款的委托进口单位,必须提供相应的海关代征增值税专用缴款书原件、委托代理合同及付款凭证,否则,不予抵扣进项税款。